home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Aminet 6 / Aminet 6 - June 1995.iso / Aminet / misc / sci / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00543 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  2.5 KB  |  54 lines
  1. **********************************
  2. * GMC oxidoreductases signatures *
  3. **********************************
  4.  
  5. Six different FAD  flavoproteins  oxidoreductases have  been found [1,2] to be
  6. evolutionary related. These  enzymes, which  are called 'GMC oxidoreductases',
  7. are listed below.
  8.  
  9.  - Glucose oxidase (EC 1.1.3.4) (GOX) from Aspergillus niger.
  10.    Reaction catalyzed: glucose  +  oxygen ->  delta-gluconolactone +  hydrogen
  11.    peroxide.
  12.  - Methanol oxidase (EC 1.1.3.13) (MOX) from fungi.
  13.    Reaction catalyzed: methanol + oxygen -> acetaldehyde + hydrogen peroxide.
  14.  - Choline dehydrogenase (EC 1.1.99.1) (CHD) from Escherichia coli.
  15.    Reaction catalyzed: choline  + unknown acceptor -> betaine  acetaldehyde  +
  16.    reduced acceptor.
  17.  - Glucose dehydrogenase (GLD) (EC 1.1.99.10) from Drosophila.
  18.    Reaction catalyzed: glucose  +  unknown acceptor ->  delta-gluconolactone +
  19.    reduced acceptor.
  20.  - Cholesterol oxidase (CHOD) (EC 1.1.3.6)  from Brevibacterium sterolicum and
  21.    Streptomyces strain SA-COO.
  22.    Reaction catalyzed: cholesterol + oxygen ->  cholest-4-en-3-one  + hydrogen
  23.    peroxide.
  24.  - AlkJ [3],  an  alcohol  dehydrogenase   from  Pseudomonas oleovorans, which
  25.    converts aliphatic medium-chain-length alcohols into aldehydes.
  26.  
  27. These enzymes are  proteins  of size ranging from 556 (CHD) to 664 (MOX) amino
  28. acid residues which share a number of regions of sequence similarities. One of
  29. these regions, located in the N-terminal section,  corresponds to the FAD ADP-
  30. binding domain.  The function of the other conserved domains is not yet known;
  31. we have selected two of these domains as signature patterns.  The first one is
  32. located in  the N-terminal  section of these  enzymes, about 50 residues after
  33. the ADP-binding  domain,  while  the  second  one  is  located  in the central
  34. section.
  35.  
  36. -Consensus pattern: [GA]-[RKN]-x-[LV]-G(2)-[GST](2)-x-[LIVM]-N-x(3)-[YWA]-
  37.                     x(2)-[PAG]-x(5)-[DEH]
  38. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  39. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  40.  
  41. -Consensus pattern: G-[STA]-x(2)-[ST]-P-x-[LIVM](2)-x(2)-S-G-[LIVM]-G
  42. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL,  except
  43.  for cholesterol oxidases.
  44. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  45.  
  46. -Last update: October 1993 / Patterns and text revised.
  47.  
  48. [ 1] Cavener D.R.
  49.      J. Mol. Biol. 223:811-814(1992).
  50. [ 2] Henikoff S., Henikoff J.G.
  51.      Genomics In Press(1994).
  52. [ 3] van Beilen J.B., Eggink G., Enequist H., Bos R., Witholt B.
  53.      Mol. Microbiol. 6:3121-3136(1992).
  54.